一艘隶属美国的核潜艇在关岛附近消失，后经日本方面证实该潜艇已因事故遇难，而防卫军在调查过程中竟然还在海底发现巨大生物的存在。与此同时，新泻妙高山、鹿儿岛池田湖、小笠原诸岛等地接连发生强烈的地震和人员伤亡事件，关于50年前那头大闹日本的哥斯拉的恐怖记忆相继在人们的脑中复苏。 　　BS电视台女记者立花由里（新山千春 饰）近期正与同事调查接二连三的怪兽事件，从一个神秘老人的口中得知，所谓哥斯拉其实是太平洋战争中丧生的人们的冤魂聚集而成的怪兽，核潜艇事故引起的核泄漏似乎意外将哥斯拉唤醒。与它一同苏醒的还有被称为护国神兽的巴拉哥、摩斯拉、基多拉。日本本土面临空前的灾难……

哥斯拉破坏日本多年，〈G对策总部〉发明黑洞炮对付。但实验出意外，引来古代巨大昆虫超翔龙重现，并攻击哥斯拉。日本成了哥斯拉、超翔龙及人类三方的战场。

喜一和基一（市原隼人 分饰）是一对双胞胎兄弟，弟弟喜一聪慧过人，人缘极佳；哥哥基一迷恋摇滚，成绩超差。这年暑假，喜一与女友相约出国旅游，因而拜托哥哥偷梁换柱，代替他参加学校组织的素粒子物理学的学术报告会。不过他的首要任务就是劝说窝在家中的天才少女沙罗华（谷村美月 饰）一同前来。 　　沙罗华是母亲通过试管受精降生到这个世上来的，她继承了科学家父亲的优秀基因，年纪轻轻便设计出巨型的粒子对撞机，被世人称为天才少女。但她似乎对周遭的一切都漠不关心，不着调的基一那句“是否能创造宇宙”的闲话令沙罗华心有所动。在学术报告会上，两人结成研究小组，开始了创造宇宙的不可能任务……

在网路上，突然出现了一隻数码蛋，这隻蛋破壳后，出生了一隻数码宝贝，它疯狂地吞噬着整个电力网络系统，给电力网络运行造成了重大影响，而且它不断地进化，食量也越来越大。太一在开始的时候和素娜吵架了，阿和和阿武外出了，美美去玩了，阿助……只有光子郎和太一在，阿武和阿和找到了电脑来支援太一，后来那个数码宝贝又一次进化了！这时候，发生了一件意想不到的事情……

20世纪末，一种神秘病毒在世界蔓延，感染者莫不血尽身亡。热爱摇滚乐的远藤贤知（唐泽寿明 饰）经历过叛逆时期，如今年奔三十的他窝在家乡大阪经营一家连锁超市，上层负责人责骂，母亲聒噪，姐姐的孩子神乃哭泣，贤知小心应付，手忙脚乱。在小学同学聚会上，贤知重逢当年好友义常（香川照之 饰）、青蛙仔（宮迫博之 饰）、丸夫（石塚英彦 饰）、福平（佐佐木藏之介）、阿门（宇梶剛士 饰）等人。从他们口中得知，如今社会上正时兴一个神秘的宗教组织，组织领袖自称“朋友”，而近期发生的一些列恐怖事件皆来自贤知众人童年时杜撰的一本“预言之书”。 　　不久，童年时的好友当机（生濑胜久 饰）自杀身亡，他在死前几天曾寄给贤知一封信，信中提到秘密基地的标志。为弄清真相，贤知和朋友们挖出当年埋在树下的铁盒，找出那本“预言之书”。他们发现，儿时胡编乱造写下的情节正在一一应验。那位“朋友”似乎就是当年这群孩子中的一员，而他的目的究竟是什么呢？

十九世纪中叶，维多利亚时代的大英帝国，工业革命方兴未艾，理性与进步似乎凌驾一切，标志了人类文明昂首进步的无限可能。 就在第一次万国博览会揭幕前夕，住在伦敦的13岁少年雷•史汀（铃木杏 Anne Suzuki 配音）突然收到发明家祖父（中村嘉葎雄 Katsuo Nakamura 配音）从美国寄来，称之为“蒸气球”（Steam Ball）的神秘动力装置。同时间，英国情报组织，以及一个名为奥哈拉基金会的黑暗组织，都觊觎“蒸气球”所蕴含的惊人力量。雷因此而突遭一伙身份不明的人的袭击，雷只好带着金属球，踏上逃亡之路。为寻求真相雷来到美国，从父亲艾迪（津嘉山正种 Masatane Tsukayama 配音）口中雷得知“蒸气球”依据全新机械理论所设计，可以产生一种划时代的庞大能源，足以供应整个国家所需。路途中，雷邂逅了美丽的富家千金斯嘉丽（小西真奈美 Manami Konishi 配音）。从小娇生惯养，却偏偏爱上了雷，自愿跟随孤独的雷一起踏上了冒险之旅……所谓的科学，究竟是人们的希望？还是将会毁灭一切。

加濑尊朗 , 布川敏和 , 木之元亮 , 鹤野刚士 , 齐藤理沙

高中生佐藤翼（石田卓也 饰）的生活一团糟，母亲早年去世，妹妹小爱（谷村美月 饰）自出生起便如木头人一般毫无知觉，而同年好友佐藤洋（大东俊介 饰）又对他反目成仇，暴力相向。与此同时，国内不断有姓佐藤的人因各种原因死亡，似乎他的生命也正受到威胁。 　　在某次冲突中，翼在众人面前离奇消失，睁开眼却发现自己处于一个平行的世界。在这里，日本变成一个君主专制的国家，拥有至高无上权力的国王出于某种目的针对姓佐藤的人展开为期一周的捉迷藏游戏。佐藤们在游戏时间内必须全力逃跑，躲开鬼的追逐，一旦被抓住就只有死路一条…… 　　本片根据山田悠介的小说改编。

1909年，著名的伊藤博文暗杀事件由于神秘人物井上源的出现被阻止，紧接着人类的历史被改写，到2009年，整个东亚地区均成为日本帝国的领土，汉城更成为日本第三个极其重要的城市。韩裔“日本人”板本正行（张东健）是日本调查局一名忠心耿耿的特务，他的好友兼搭档是西乡将二郎（仲村亨），而他的强劲对手是名叫“朝鲜自由”的地下抗日组织。“朝鲜自由”制造了对井上美术博物馆的恐怖袭击，板本正行受命调查时，一块来自石器时代的出土于中国哈尔滨的石头“月灵”令他于无意间发现日本帝国隐藏了整整一百年的大阴谋，重新选择了人生道路，更与西乡将二郎由朋友变成敌人。

宫本(金城武饰)是一个「Returner」，职责是替聘用者潜入黑市的深处，盗取大笔大笔无迹可寻的巨款，以极高效率将款项安全交到聘用者手上。宫本本为一个孤儿，他的童年好友喜宽被一个神秘人杀死，宫本已下定决心要找出凶手报仇。在横滨的海岸，宫本正要潜入另一个地下世界，遇上当年杀死他好友的凶手。宫本按捺不住激动的情绪展开一场死斗时，错手枪伤了一名来自未来的无辜少女美里 (铃木杏饰)。美里大难不死，还聘请宫本替她完成一项特别任务，一同两天内将世界从危难中解脱