在前一季里面，为了摆脱仇杀，杰克（基弗·萨瑟兰 Kiefer Sutherland 饰）利用计谋脱离，隐姓埋名过着普通的生活。然而，随着前总统大卫·鲍尔默（丹尼斯·海斯伯特 Dennis Haysbert 饰），前同事米歇尔（蕾可·艾尔丝沃斯 Reiko Aylesworth 饰）和托尼（ 卡洛斯·博纳德 Carlos Bernard 饰）相继被杀，最后一位知道杰克还活着的同事克洛伊（玛丽·莱恩·莱杰斯库 Mary Lynn Rajskub 饰）也受到了死亡威胁。不得已，克洛伊拨通了杰克的电话，想找他寻求帮助。而在克洛伊和杰克见面时，杀手出现，杰克最终以不凡的伸手抓住了追杀他们的人。并从其口中逼问出，原来刺杀前总统是他们的主要任务，其他目标只是为了能将调查的矛头指向杰克，让杰克成为这次刺杀任务的替罪羊。杀掉前总统，目的也是为了灭口，不想前总统公布某些...
在经历了上一次的恐怖袭击之后，由于政府对CTU应对恐怖事件的解决方式不太满意，还是最终决定解散CTU。杰克·鲍尔（基弗·萨瑟兰 Kiefer Sutherland 饰）也因使用酷刑等非法手段来防止恐怖袭击，而受到审查。原本以为自己终将在监狱里度过余生，却因死而复生的前同事托尼（卡洛斯·博纳德 Carlos Bernard 饰）的出现，彻底打乱了杰克现有的生活。托尼希望杰克能与他一起，共同调查又一次在美国大路上展开的恐怖袭击。而随着调查的不断深入，杰克觉得身边的托尼越来越琢磨不透。杰克一直觉得托尼有什么事情没有对他说明白。由于新总统对杰克的信任，所以他们的调查之路虽然危机重重，但是开展得还算顺利。不过，最后杰克终于发现这次恐怖袭击的幕后策划者，原来是一直与他并肩作战的朋友托尼……
